La gouvernance coopérative est un élément important de la culture Migros. La gestion correcte et scrupuleuse de la coopérative est une tâche essentielle pour l’administration et la direction générale. Les décideurs sont conscients de leur responsabilité économique, sociale et écologique envers tous les stakeholders.
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Migros comptait à fin 2010 plus de 2 millions de coopérateurs rassemblés au sein des 10 coopératives fédérées. Ceux-ci sont copropriétaires de Migros. Les coopératives fédérées détiennent quant à elles des parts sociales de la Fédération des coopératives Migros (FCM) qui coordonne les activités de la communauté Migros et en arrête la stratégie.