La conduite opérationnelle des affaires de la Fédération des coopératives Migros incombe aux sept membres de la Direction générale. Son président dirige cet organe et assume la responsabilité de la gestion. Les six autres membres sont en charge respectivement du département Ressources humaines - Affaires culturelles et sociales - Loisirs / Marketing / Logistique et informatique / Industrie / Finances / Commerce de marchandises.